EVOLUCIÓN DE LA DIVERSIDAD METABÓLICA

GRUPOS DE TRABAJO

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Dr. Francisco (Paco) Barona Gómez

Investigador Principal

Nos interesan los aspectos evolutivos y mecanísticos -a nivel del genoma- que permitieron la aparición del metabolismo bacteriano, incluidos sus genes, enzimas y metabolitos. Nos centramos principalmente en el grupo de las actinobacterias (por ejemplo, Streptomyces y Clavibacter), pero también en otros filos identificados después de estudios ecológicos (por ejemplo, cianobacterias), para la exploración experimental y computacional de hipótesis evolutivas.

Líneas de investigación:

  • Evolución de la especificidad de sustrato a través de enzimología comparada para el estudio de familias de enzimas homólogas.
  • El ensamblaje de las rutas como directriz para la síntesis de nuevos y complejos productos naturales, y su caracterización bioquímica.
  • Estudio del papel biológico de metabolitos especializados a través del análisis de interacciones microbianas.
  • Estudio de las fuerzas evolutivas detrás de la dinámica genómica, y la diversificación metabólica que conllevan a la adaptación a un nicho, por medio de la filogénomica.

Proyectos recientes:

  • "Co-evolución planta-bacteria en el contexto del fitobioma: el caso del metabolismo especializado de bacterias del orden Micrococcales en solanáceas agrícolas y silvestres". Ciencia Básica 2016, CONACYT (2018-2020).
  • “Descubrimiento de nuevos antibióticos a través de Evomining y fenotipos de adecuación”. Texas A&M University-CONACYT, (2017-2018).
  • Transferencias tecnológicas a compañías nacionales e internacionales dentro de los campos de agrobiotecnología y farmacéutica.

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Dr. Francisco (Paco) Barona Gómez

Investigador Principal

francisco.barona@cinvestav.mx

Romina Berni Paredes

Auxiliar administrativo

“Contactar en caso de estar interesados en visitar el laboratorio, realizar estancias, tesis de licenciatura, maestría, doctorado, entrevistas o proyectos, etc.”

romina.berni@cinvestav.mx

M.C. Hilda Eréndira Ramos Aboites

Auxiliar de Investigación

“Especialista en métodos analíticos para purificación e identificación de metabolitos y proteínas. Mi interés particular es el estudio de la influencia metabolómica en las interacciones microbianas”

hilda.ramos@cinvestav.mx

Dr. César Aguilar

Posdoc

“Mi formación de doctorado fue en ingeniería metabólica en el Instituto de Biotecnología de la UNAM. Actualmente estoy trabajando en la reconstrucción y caracterización de nuevas vías que dirigen la biosíntesis de productos naturales en Streptomyces”

cesar.aguilar@cinvestav.mx

Dra. Karina G. Gutiérrez García

Posdoc

"Realicé mi doctorado en el Dpto. de Biotecnología del Cinvestav, Zacatenco estudiando a través de filogenómica las Pseudomonas endófitas de Piper auritum productoras del 2,4-Diacetilfloroglucinol y su nueva actividad anti-glicación. Ahora estoy interesada en el descubrimiento de nuevos productos naturales a partir de Cyanobacterias endófitas de las raíces coraloides de cícadas pertenecientes al género mexicano Dioon. Mi investigación abarca el uso de genómica, metagenómica y técnicas analíticas químicas"

karinagtzg@hotmail.com

Dra. Vanina D. Varni

Posdoc

“Actualmente participo en el estudio filogenético de Clavibacter michiganensis, una actinobacteria que produce la enfermedad llamada" cancro bacteriano "en tomates. El objetivo es comprender las relaciones filogenéticas entre las cepas de micrococos asociadas al género Clavibacter en microbioma de tomate. punto de partida para establecer un marco en el que buscamos marcadores genéticos que proporcionen una resolución filogenética más alta dentro del género Clavibacter, como en el orden Micrococcales”

vanina.varni@cinvestav.mx

M.C. Nelly Sélem Mojica

Estudiante de Doctorado en Biología Integrativa

"Estoy interesada en genómica, evolución y bioinformática. He trabajado en el desarrollo de herramientas genómicas comparativas. Actualmente desarrollo las herramientas EvoMining y CORASON, la primera para la detección de enzimas divergentes reclutadas a metabolismo secundario y la segunda para investigar la variación del contexto genómico de dichas enzimas. Además, trabajo en investigar el rol de la promiscuidad enzimática en la evolución de la función bioquímica usando como modelo a Actinobacteria"

nelly.selem@cinvestav.mx

Lic. Alan G. Yañez Olvera

Estudiante de Maestría en Biotecnología de Plantas

“Soy un estudiante de maestría, trabajando actualmente en filogenómica de Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis. El objetivo de mi investigación es determinar si hay rasgos funcionales relacionados claramente con el estilo de vida de este anfibionte”

alan.yanez@cinvestav.mx

M.C. Daniel E. Bustos Díaz

Staff

“Realice mi maestría en @EvoDivMet en Biología Integrativa trabajando en el papel del metabolismo del nitrógeno en las raíces coralloides de la cícada mexicana Dioon edule. Actualmente estoy colaborando en este proyecto, así como en una colección especial de Frontiers en Young Minds para ayudar a realizar conciencia sobre la importancia de la ciencia a las nuevas generaciones en México”

Juan D. Camarena Alba

Estudiante de Licenciatura

"Soy un estudiante de pregrado en biotecnología en el IPN-UPIIG. Mi tesis se centra en el estudio del microbioma de la raíz coraloide de Dioon edule en respuesta al nitrógeno a través de cultivos de sub-comunidades, y cómo esto se relaciona con la expresión del genes biosintéticos que codifican productos naturales"

zhughno@gmail.com