Genómica y Biodiversidad de Vertebrados

GRUPOS DE TRABAJO

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Más sobre nosotros:

Dr. Sean M. Rovito

Investigador Principal

Usamos herramientas moleculares para estudiar los procesos que han producido la diversidad impresionante de especies de vertebrados en Mesoamérica, y usamos esta diversidad de especies para contestar preguntas evolutivas. Además, intentamos aplicar los resultados de los estudios evolutivos y ecológicos de los vertebrados mesoamericanos para promover su conservación.
Actualmente, los proyectos del laboratorio usan las salamandras apulmonadas Neotropicales como un modelo de estudio, pero estamos abiertos a trabajar con otros vertebrados.

Líneas de investigación:

  • Especiación de salamandras en el Eje Transversal de México: En este proyecto, usamos miles de marcadores genéticos generados por secuenciación de transcriptomas para probar hipótesis geográficas y demográficas del proceso de la formación de especies de salamandras del género Pseudoeurycea.
  • Microbiomas de salamandras en el Eje Transversal de México: Usamos secuenciación masiva de amplicones para caracterizar la diversidad de bacterias y hongos presentes en la piel de salamandras. Además, investigamos cuales factores (historia evolutiva, medio ambiente, espacio geográfico) tienen mayor impacto sobre la composición del microbioma entre sitios y especies de salamandras.
  • Microbiomas bacterianos y fúngicos de salamandras cavernícolas de México: Caracterizamos el microbioma de salamandras cavernícolas de México con herramientas genómicos y metagenómicos y buscaremos bacterias con propiedades antifúngicas que podrían proteger los anfibios contra brotes de enfermedades fúngicas.

Proyectos recientes:

  • "Modos de especiación y la evolución de salamandras y su microbioma cutáneo en las cordilleras volcánicas de Mesoamérica". SEP - CONACYT - Ciencia Básica no. 221614 (2015–2018).
  • "Desarrollo de una estrategia de conservación contra enfermedades infecciosas fúngicas a través de la caracterización y el uso del microbioma de la piel de salamanders". CONACYT - Atención a Problemas Nacionales no. 2250-6 (2017–2018).
  • "Genómica de la especiación en vertebrados terrestres de las Islas Revillagigedo". UC Mexus - CONACYT (2017–2018).

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Dr. Sean M. Rovito

Investigador Principal

"Sistemática y especiación de salamandras Neotropicales; Caracterización del microbioma de salamandras y diversificación y evolución de salamandras"

sean.rovito@cinvestav.mx

Ing. Ana Mayela Ornelas Morin

Auxiliar de investigación

"Fisiología térmica de salamandras de México"

mayela.orelas@cinvestav.mx

Dr. Christopher James Evelyn

Posdoc

"Especiación parapátrica de salamandras pletodóntidas"

evelync@ucr.edu

M.C. Julio César García Sánchez

Estudiante de Doctorado en Biotecnología de Plantas

"Microbioma bacteriano de salamandras del Eje Neovolcánico de México en un contexto filogenético, Caracterización del microbioma bacteriano de salamandras cavernícolas de Mexico y desarrollo de una estrategia de conservación para ellas"

julio.garcia@cinvestav.mx

M.C. María Guadalupe Segovia

Estudiante de Doctorado en Biotecnología de Plantas

"Investigación de la demografía y geografía de especiación de salamandras del Eje Neovolcánico de México usando datos transcriptómicos"

maria.segovia@cinvestav.mx

M.C. Louis Paul Decena Segarra

Estudiante de Doctorado en Biotecnología de Plantas

"Evolución del tamaño del genoma en salamandras Neotropicales"

louis.decena@cinvestav.mx

Lic. Zeltzin Corina Rodríguez Ortiz

Estudiante de Maestría en Biología Integrativa

"Patrones de diversidad beta en salamandras Neotropicales"

zeltzin.rodriguez@cinvestav.mx

Lic. Juan Alfredo Gutiérrez Morales

Estudiante de Maestría en Biología Integrativa

"Especiación de lagartijas del genero Urosaurus en las Islas Revillagigego"

juan.gutierrez@cinvestav.mx

Lic. Emanuel Martinez Ugalde

Estudiante de Maestría en Biotecnología de Plantas

"Caracterización del microbioma fúngico de salamandras cavernícolas de México"

emanuel.martinez@cinvestav.mx

Ing. Mizraim Olivares Miranda

Estudiante de Maestría en Biotecnología de Plantas

"Papel de quitridiomicosis en declives de salamandras cavernícolas de México"

mizraim.olivares@cinvestav.mx

Lic. Jorge Alejandro López Torres

Estudiante de Maestría en Biotecnología de Plantass

"Ecomorfología y ecología de comunidades de salamandras Neotropicales"

alejandro.lopez@cinvestav.mx

Ariadna Marcela Tenorio Olvera

Tesista de Licenciatura

"Desarrollo de una metodología para elaborar librerías de amplicones del gen 16S del microbioma bacteriano intestinal de salamandras pletodóntidas (Plethodontidae)"

ariadnatenorio1995@gmail.com