Expresión Génica y Desarrollo en Hongos

Nuestro grupo de trabaja en el análisis de genómica funcional de plantas y hongos.
Estudiamos cultivos de importancia estrategica para México, con especial enfásis en el frijol común, donde nuestros principales intereses son determinar la influencia de eventos de introgresión y de la domesticación en la estructura y función de su genoma. En hongos, usamos como modelo al micoparásito Trichoderma atroviride para estudiar factores determinantes en el modelo fungico para entender procesos de regeneración de tejido y los mecanismos moleculares que los subyacen.
Nuestro grupo busca generar conocimiento de frontera a la par de el entrenamiento de científicos independientes, competitivos al más alto nivel internacional.

Lineas de investigación:

• Análisis transcriptómicos del desarrollo de hongos.
• Transducción de señales durante el desarrollo de hongos.
• Moléculas señal y su percepción en la comunicación planta-hongo.
• Identificación y caracterización de factores de transcripción involucrados en el desarrollo.
• Regulación epigenética de la regeneración y el desarrollo.
• Secuenciación y análisis de genomas completos de plantas y hongos.
• Domesticación y evolución de cultivos mexicanos.

Proyectos recientes:

• Integración Genómica para acelerar la Caracterización y Mejoramiento de cultivos Estratégicos en México. SAGARPA-CONACYT no. 292546 (2018-2020).
• "Bases moleculares de la regeneración a través de la evolución" CONACYT-Fronteras de la Ciencia no. 301 (2016-2018).
• "Role of the Trichoderma RNAi machinery in in the establishment of its symbiotic interaction with plants" CONACYT-CB no. 236825 (2015-2018).
• "The Inheritance of Pod Dehiscence in Common Bean, a Crucial Trait of its Domestication". UC-MEXUS-CONACYT (2017-2018).

Publicaciones más relevantes:

• 1. Danger signals activate a putative innate immune system during regeneration in a filamentous fungus. Plos Genet. 14(11): e1007390.
  2018.
• 2. Genomic history of the origin and domestication of common bean unveils its closest sister species. Genome Biol. 18: 60. DOI 10.1186/s13059-017-1190-6. 2017. Best of 2017: Top Picks from Genome Biology.
• 3. Comparative genome sequence analysis underscores mycoparasitism as the ancestral life style of Trichoderma. Genome Biol. 12:R40 doi:10.1186/gb-2011-12-4-r40. 2011.
• 4. BLR-1 and BLR-2, key regulatory elements of photoconidiation and mycelial growth in Trichoderma atroviride. Microbiology 150: 3561-3569. DOI 10.1099/mic.0.27346-0. 2004.
• 5. Characterization of ech-42, a Trichoderma harzianum endochitinase gene expressed during mycoparasitism. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91(23): 10903-10907.
  1994.

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