Metabolómica y Espectrometría de Masas

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Dr. José Juan Ordaz Ortiz

Investigador Principal

La metabolómica es el estudio de las moléculas pequeñas o metabolitos (metaboloma) de una célula, tejido u organismo entero. Este tipo de métodos son complementarios a los análisis genómicos, transcriptómicos y proteómicos para la caracterización molecular de los sistemas biológicos y de sus cambios. La metabolómica se define también como el análisis exhaustivo de todos los compuestos de bajo peso molecular (< 1500 Da) en un sistema biológico o una parte de este; como podría ser el extracto de la raíz de una planta. El metaboloma vegetal comprende una amplia gama de especies químicas con diversas propiedades físicas; desde compuestos inorgánicos iónicos hasta carbohidratos hidrofílicos, ácidos orgánicos y aminoácidos y una gama de compuestos hidrofóbicos relacionados como los lípidos. El metaboloma vegetal ha recibido cada vez más atención en los últimos años, debido a su importancia en los estudios de salud, alimentación y nutrición, el estudio de la calidad de alimentos y el mejoramiento de los cultivos.

Líneas de investigación:

  • Desarrollo y aplicación de una gama de metodologías de cromatografía y espectrometría de masas, para el análisis estructural de moléculas biológicamente activas, con el fin de comprender su mecanismo de acción a nivel molecular.
  • Descubrimiento de nuevos metabolitos y metabolómica cuantitativa.
  • Perfil de metabolitos como: carbohidratos no estructurales, compuestos orgánicos semi volátiles, volátiles y no volátiles, hormonas vegetales y fenilpropanoides.
  • Caracterización de compuestos bioactivos a partir de extractos de plantas.
  • Polisacáridos de la pared celular vegetal mediante el análisis estructural usando MS, GC-MS e hidrólisis enzimática, así como la inmunodetección usando sondas moleculares específicas.

Proyectos recientes:

  • Comparación del metaboloma y transcriptoma en Capsicum.
  • Construcción de la huella metabolómica de un suelo, mediante análisis no dirigido.
  • Exploración genómica de Vanilla planifolia para la elucidación de rutas biosintéticas del metabolismo secundario de frutos
  • Perfil global de metabolitos foliares para la identificación de especies de Vainilla
  • Identificación de nuevos fructanos de Agave tequilana Weber var. Azul utilizando Espectrometría de Masas con Movilidad Iónica
  • Caracterización de fructosiltransferasas de Agave tequilana

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Dr. José Juan Ordaz Ortiz

Investigador principal

jose.ordaz.ortiz@cinvestav.mx

M.C. Paulina Guevara Domínguez

Auxiliar de investigación

“Encargada de la plataforma de servicios de metabolómica”

paulina.guevara@cinvestav.mx

M.C. Rebeca Hernández Peña

Estudiante de doctorado en Biotecnología de plantas

“Exploración genómica de Vanilla planifolia para la elucidación de rutas biosintéticas del metabolismo secundario de frutos”

rebeca.hernandez@cinvestav.mx

M.C. Felipe de Jesús Cervantes Hernández

Estudiante de Doctorado en Biotecnología de Plantas

"Integración de datos metabolómicos y trasncriptómicos en modelos de redes dinámicas durante el desarrollo del fruto de chile (codirección con el Dr. Octavio Martínez)”

felipe.cervantes@cinvestav.mx

IBQ. Luis Alfredo Antúnez Albarrán

Estudiante de Maestría en Biotecnología de Plantas

"Perfil global de metabolitos foliares para la identificación de especies de vainilla"

luis.antunez@cinvestav.mx

IBQ. Macrina Eréndira López Rosas

Estudiante de maestría en Biotecnología de plantas

"Caracterización de fructosiltransferasas de Agave tequilana” (Codirección con la Dra. June Simpson)"

macrina.lopez@cinvestav.mx

IBQ. Luis Fernando Pérez Vega

Estudiante de Maestría en Biotecnología de Plantas

"Identificación de nuevos fructanos de Agave tequilana Weber var. Azul utilizando Espectrometría de Masas con Movilidad Iónica"

luis.perez@cinvestav.mx

Ing. Oscar Fernández Fernández

Estudiante de Maestría en Biotecnología de Plantas

"Perfil metabolómico de un suelo regado con aguas residuales"

oscar.fernandez@cinvestav.mx

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