Genómica y Biodiversidad de Vertebrados

Usamos herramientas moleculares para estudiar los procesos que han producido la diversidad impresionante de especies de vertebrados en Mesoamérica, y usamos esta diversidad de especies para contestar preguntas evolutivas. Además, intentamos aplicar los resultados de los estudios evolutivos y ecológicos de los vertebrados mesoamericanos para promover su conservación.
Actualmente, los proyectos del laboratorio usan las salamandras apulmonadas Neotropicales como un modelo de estudio, pero estamos abiertos a trabajar con otros vertebrados.

Líneas de investigación:

• Especiación de salamandras en el Eje Transversal de México: En este proyecto, usamos miles de marcadores genéticos generados por secuenciación de transcriptomas para probar hipótesis geográficas y demográficas del proceso de la formación de especies de salamandras del género Pseudoeurycea.
• Microbiomas de salamandras en el Eje Transversal de México: Usamos secuenciación masiva de amplicones para caracterizar la diversidad de bacterias y hongos presentes en la piel de salamandras. Además, investigamos cuales factores (historia evolutiva, medio ambiente, espacio geográfico) tienen mayor impacto sobre la composición del microbioma entre sitios y especies de salamandras.
• Microbiomas bacterianos y fúngicos de salamandras cavernícolas de México: Caracterizamos el microbioma de salamandras cavernícolas de México con herramientas genómicos y metagenómicos y buscaremos bacterias con propiedades antifúngicas que podrían proteger los anfibios contra brotes de enfermedades fúngicas.

Proyectos recientes:

• "Modos de especiación y la evolución de salamandras y su microbioma cutáneo en las cordilleras volcánicas de Mesoamérica". SEP - CONACYT - Ciencia Básica no. 221614 (2015–2018).
• "Desarrollo de una estrategia de conservación contra enfermedades infecciosas fúngicas a través de la caracterización y el uso del microbioma de la piel de salamanders". CONACYT - Atención a Problemas Nacionales no. 2250-6 (2017–2018).
• "Genómica de la especiación en vertebrados terrestres de las Islas Revillagigedo". UC Mexus - CONACYT (2017–2018).

Publicaciones más relevantes:

• 1. Testing models of refugial isolation, colonization and population connectivity in two species of montane salamanders. Heredity 119: 265–274. 2017.
• 2. The geography of speciation in neotropical salamanders. Herpetologica 73: 229–241. 2017.
• 3. Biology of tiny animals: three new species of minute salamanders (Plethodontidae: Thorius) from Oaxaca, Mexico. PeerJ 4:e2694. 2016.
• 4. Neotropical plethodontid biogeography: insights from molecular phylogenies. Copeia 104: 222–232. 2016.
• 5. Diversification and biogeographic history of Neotropical plethodontid salamanders. Zoological Journal of the Linnean Society 175: 167–188, 2015.

Publicaciones recientes:

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